La función de los ARNt y la regulación de su actividad requiere modificaciones específicas. Defectos en las modificaciones de ARNt pueden causar producción de proteínas defectuosas o incompletas, y la desregulación de las modificaciones del ARNt está asociado con varias enfermedades humanas, incluidas las enfermedades neurodegenerativas, metabólicas y cáncer. Los métodos actuales para secuenciar y cuantificar ARNt consisten en técnicas basadas en la secuenciación de segunda generación. Sin embargo, estos métodos no son capaces de detectar modificaciones de los ARNt, y sufren de severas limitaciones para cuantificar de manera correcta las abundancias de los mismos, debido a la presencia de modificaciones y estructuras secundarias y terciarias, que limitan la conversión de ARN a ADN complementario. El equipo del Centro de Regulación Genómica (CRG) de Barcelona, liderado por la Dra. Eva Maria Novoa, ha publicado en Nature Biotechnology el método denominado Nano-tRNAseq que puede medir tanto la abundancia como las modificaciones de las moléculas de ARNt en un solo paso. NanotRNAseq se basa en una tecnología que puede secuenciar las moléculas de ARN directamente pasándolas a través de un nanoporo. Cada uno de los nucleótidos que componen una molécula de ARN tiene un tamaño y una forma ligeramente diferente, que se refleja en un cambio en la corriente eléctrica que se genera cuando cada nucleótido pasa a través del poro. Los programas computacionales detectan cambios en esta corriente para identificar el nucleótido, establecer la secuencia del ARNt, incluyendo las modificaciones que puedan tener de forma rápida y con alto rendimiento. Por todo ello, este método puede ser fundamental para aplicar esta tecnología en un futuro para la toma de decisiones clínicas.
