La ruta de señalización del ácido retinoico, un metabolito producido a partir de la vitamina A, es esencial para el desarrollo embrionario y está implicada en la formación del patrón anteroposterior del sistema nervioso y del corazón, entre otros procesos. Se sabía que en modelos de ratón y pez cebra, el ácido retinoico podía reconfigurar la cromatina y activar elementos reguladores en cis (CRE). El equipo liderado por José María Santos Pereira del Centro Andaluz de Biología del Desarrollo (CABD), actualmente en la Universidad de Sevilla y el Instituto de Biomedicina de Sevilla (IBiS), ha descrito que esta ruta es capaz de modificar la expresión de los genes mediante el establecimiento de contactos tridimensionales (3D) en el genoma. Usando embriones de pez cebra como organismo modelo e integrando aproximaciones de RNA-seq, ATAC-seq, ChIP-seq y HiChIP, han encontrado que esta ruta de señalización pone en marcha su programa específico de expresión génica activando multitud factores de transcripción, entre los que se incluye el propio receptor de ácido retinoico y otros activados por este como HoxB1, Meis2 y Sox3, que cooperarían promoviendo el desarrollo y modelado del sistema nervioso central. Estos hallazgos abren la posibilidad de profundizar en la implicación de los factores de transcripción en este plegamiento y tienen gran relevancia para las enfermedades humanas, ya que las alteraciones de la estructura 3D del genoma pueden dar lugar a enfermedades neurodegenerativas, malformaciones hereditarias y cáncer.
