Cristina Muñoz-Pinedo es licenciada en Biología por la Universidad de Sevilla. Realizó su tesis doctoral en Granada, en el Instituto de Parasitología y Biomedicina (CSIC), bajo la dirección de Abelardo López Rivas con quien estudió la muerte celular inducida por la inhibición del metabolismo de nucleótidos y por ligandos de muerte. Tras varias estancias en grupos que trabajaban en distintos aspectos de la muerte celular, realizó una estancia postdoctoral de 2002 a 2005 en San Diego (EEUU), en La Jolla Institute for Allergy and Immunology en el grupo de Doug Green, y posteriormente durante unos meses en St. Jude Children’s Research Hospital en Memphis (EEUU). Durante este período estudió el papel de las mitocondrias como «víctimas» y ejecutoras de la apoptosis. Se incorporó en 2006 al Instituto de Investigación Biomédica de Bellvitge (IDIBELL) como investigadora Miguel Servet donde dirige el grupo de Regulación de la Muerte Celular.